Die Zertifizierungsstelle für Managementsysteme des Forschungsinstituts ist seit Juni 1998 durch die DAkkS (Deutsche Akkreditierungsstelle) akkreditiert. Unternehmen können die Leistungen von FIZ-Zert unabhängig von Standort, Mitgliedschaft in Verbänden und sonstigen Einschränkungen in Anspruch nehmen.
FIZ-Zert ist zunächst für die Zertifizierung von Qualitätsmanagementsystemen nach DIN EN ISO 9001 eingerichtet worden, um mögliche Synergien mit der gesetzlich geforderten Produktzertifizierung nutzen zu können. Seit 2003 ist FIZ-Zert auch für die Zertifizierung von Umweltmanagementsystemen nach ISO 14001 akkreditiert. Im Jahr 2004 hat FIZ-Zert erstmals auch Verifizierungen von CO2-Emissionen gemäß Treibhausgas-Emissionshandelsgesetz (TEHG) an insgesamt 28 Zementwerksstandorten durchgeführt.
Seit Dezember 2010 ist FIZ-Zert durch die DAkkS als Zertifizierungsstelle für Energiemanagementsysteme nach DIN EN 16001 akkreditiert.
